画像左下のように、あらかじめキャラごとに
設定色（パレット）を用意しておくと作業がとてもラクです。
（『SAI』のパレットでも良いんですが、増えるとややこしくなるので…）

線画フォルダの上にレイヤーを新規作成して
をチェック、そのレイヤーに
好きな色をバケツ塗りで流し込みましょう。

複数の線画レイヤーを一気に色替えしたい時は
最初に紹介した方法よりも、こっちのほうが手っ取り早いです。

まずここに、ど下手くそな「SUB-ROW」の文字があるとしましょう。
（このレイヤーを「ベース」と呼ぶことにします）

（左画像は「ベース」を非表示にしてあります）

この状態で、上にある熊猫レイヤーの
　をチェックすると…

このように、下にある「ベース」に色が乗っている範囲だけ
クリッピングした熊猫レイヤーの画像が表示される、という機能です。

先ほどと同じ要領で言えば、熊猫レイヤーの代わりに
塗りつぶし⇒クリッピングで、「SUB-ROW」の文字色を
変える事も簡単に出来ますね。

…ただ、コレだけだと何が便利なのピンとこないかも知れないので
もうちょっと実用例を挙げてみましょう。

エプロンのレイヤーを「ベース」にして、
模様の画像をその上に作成。これをクリッピングします。

これだと少しバランスが悪いので
「模様を左に寄せたいな…」と思ったとします。

なんとこの機能、レイヤー同士だけでなく
フォルダを丸ごとクリッピングさせたりする事も出来ちゃうんです。

今度は肌レイヤーの上に「色」フォルダを新規作成。
それをクリッピングして、そのフォルダ内で
各パーツごとにレイヤーを分けて塗っていきます。

このようにガンガンはみ出ていても、クリッピングのおかげで
「ベース」となる肌レイヤーの範囲外は表示されないので
はみ出すのを恐れずに塗っていけるのも利点のひとつです。

ズボンの色を塗ったレイヤー「服１」の上に新規レイヤー。
下半分を濃い緑で塗り、これを「服１」にクリッピングします。

つまり、肌レイヤーにクリッピングした「色」フォルダの中で
さらにレイヤー同士のクリッピングを行っている事になりますね。
文章にしてみるとややこしいです。

ただ欲を言えば、もう少し滑らかな
グラデーションにしたいなぁと思ったので…

クリッピング機能の活用法まだまだたくさんあるので
色々と試してみると面白いかもしれません。

ちなみにこの機能、影を塗る時なんかにも大活躍です（後述）。

画像クリックで線画表示。